Jei licencijos turėtojas nesilaiko licencijuojamos veiklos sąlygų, pažeidžia įstatymų ir kitų teisės aktų, susijusių su licencijuojama veikla, reikalavimus, jam sustabdomas licencijos galiojimas. Galiojimo sustabdymo panaikinimas panaikinamas vadovaujantis Lietuvos Respublikos tabako, tabako gaminių ir su jais susijusių gaminių kontrolės įstatymo nustatytais atvejais.
Juridinis asmuo ar užsienio juridinio asmens filialas (toliau – įmonė), norintis, kad būtų panaikintas licencijos galiojimas, pateikia paraišką panaikinti licencijos galiojimą. Įmonė privalo grąžinti licencijos originalą ją išdavusiai institucijai per 5 darbo dienas po licencijos galiojimo panaikinimo.